雑記帳

　チベット高原の紀元前二千年紀のウシ属のゲノムデータを報告した研究（Chen et al., 2024）が公表されました。本論文は、中華人民共和国青海省海西モンゴル族チベット族自治州都蘭（Dulan）県の諾木洪（Nuomuhong）文化に属する関鍵詞為（Tawendaliha）遺跡で発見され、ウシ属遺骸3個体のゲノム解析によって、他のウ…

　抽象的表現の神経学的基盤に関する研究（Courellis et al., 2024）が公表されました。ヒトは、変化する環境に素早く適応できる、卓越した認知能力を有しています。この能力の中心にあるのは高水準の抽象的表現を形成する能力で、外界に存在する規則性を利用して一般化を支えています。しかし、こうした表現が、神経細胞集団中でどのように…

　カンブリア紀の真節足動物の幼生化石を報告した研究（Smith et al., 2024）が公表されました。カンブリア紀の真節足動物の放散は適応性のあるボディープランに起因する、と考えられます。その複雑な脳と特殊化した摂食用付属肢は、連続的な繰り返し構造を持つ器官系と関節のある付属肢がより精緻化したもので、真節足動物の広範な生態学的環境…

　初期の小型哺乳類の成長に関する研究（Panciroli et al., 2024）が公表されました。現生の哺乳類群は通常、幼体期に急速に成長し、成体期には成長が停止します。成体の体格が小さい種は一般的に、体格の大きい種よりも発育が早く、成熟が若く、寿命が短く、出産数が多くなります。一方で、最初期の哺乳型類（哺乳類およびそれらにごく近縁…

　野生アフリカゾウ（Loxodonta africana）の「名前」での呼びかけに関する研究（Pardo et al., 2024）が公表されました。個体名はヒト系統の普遍的特徴ですが、他の種には類例がほとんど存在しません。非ヒト動物では、イルカやオウムは相手の呼びかけを模倣して同種に呼びかけるのに対して、ヒトの名前は名指しされた個体が…

　取り上げるのが遅れてしまいましたが、三畳紀（約2億5200万年前～2億100万年前）のワニに似た小型爬虫類に関する研究（Müller., 2024）が公表されました。恐竜類や翼竜類の出現以前の三畳紀において、ワニ系統の爬虫類である偽鰐類が陸上生態系を支配していました。当時の四足爬虫類の一般的な形態だったこの系統は、いくつかのさほど包括…

　氷河の後退で出現した陸上生態系の発達に関する研究（Ficetola et al., 2024）が公表されました。氷河の全球的な後退は山岳および高緯度地域の景観を劇的に変化させつつあり、一見不毛な土地から新たな生態系が発達しています。こうした新たに出現した生態系に関する研究は、気候変動が微小生息地や生物群集とどのように相互作用し、氷の消…

　最終氷期極大期（Last Glacial Maximum、略してLGM）において北大西洋亜熱帯循環は現在よりも深かったことを報告した研究（Wharton et al., 2024）が公表されました。亜熱帯循環（Subtropical gyre、略してSTG）の深さと強度は、風応力カールと海面浮力強制により制御されています。現在の海洋観…

　家畜番犬（Livestock guarding dog、略してLGD）の進化史に関する研究（Coutinho-Lima et al., 2024）が公表されました。本論文は、現代と古代のイヌ（Canis lupus familiaris）のゲノムデータを用いて、LGDの進化史を検証しました。その結果、現代のLGD品種は2系統に分かれ、…

　現代人の遺伝子発現の差異に関する研究（Taylor et al., 2024）が公表されました。遺伝子発現やスプライシングに影響を及ぼす遺伝的多様性は、表現型の多様性の重要な要因です。これらの結びつきをヒトにおいて調べる研究はひじょうに貴重ですが、参加者がヨーロッパ系に大きく偏っているため、これが一般化の制約となり、進化研究を妨げてい…

　初期の四肢類の地理的分布に関する研究（Marsicano et al., 2024）が公表されました。四肢類の初期進化に関する現在の仮説では、石炭紀の古赤道の石炭を生成した、広範な湿地との密接な生態学的および生物地理的関係を前提としており、太古の四肢類群は後期石炭紀（約3億700万年前）に現代の羊膜類および平滑両生類の近縁動物によって…

　アメリカ合衆国の退役軍人の大規模なゲノムデータを報告した研究（Verma et al., 2024）が公表されました。日本語の解説記事もあります。GWAS（genome-wide association studies、ゲノム規模関連研究）から得られた調査結果は、疾患の遺伝学的基礎の基本的知識を提供し、予防と治療のための精密な手法を促…

　言語理解時の意味の符号化を単一細胞分解能で追跡した研究（Jamali et al., 2024）が公表されました。ヒトは、言語音や文字の列から、言語を介して豊かで微妙な差異を含む意味を抽出できます。この能力は、ヒトの意思疎通に必須です。しかし、言語や意味の処理を支える脳領域についての理解が進んだ今でも、細胞水準かつ活動電位の時間規模で…

　古代ゲノムデータから絶滅前のケナガマンモス（Mammuthus primigenius）の歴史を推測した研究（Dehasque et al., 2024）が公表されました。本論文は、ランゲル（ウランゲリ）島（Wrangel Island）を中心に、シベリアのケナガマンモスの古代ゲノムデータから、ケナガマンモスが絶滅前にどのような個体群…

　23億年前の大気と海洋の連結した酸素化の開始に関する研究（Ostrander et al., 2024）が公表されました。25憶年前の太古代から原生代への移行期の直後における分子状酸素（O₂）の最初の増加は、かつて想定されていたような単一段階の変化よりも複雑なものでした。硫黄の質量非依存分別の記録は、この大気中O₂の増加が振動的で、お…

　ヒトマラリアの歴史に関する研究（Michel et al., 2024）が公表されました。マラリアの原因となるプラスモジウム属（Plasmodium）の原虫は、過去にはヒトゲノムに対してひじょうに強力な選択圧を及ぼしてきており、抵抗性アレル（対立遺伝子）は、これらの原虫種の歴史的な広がりの概要を示す生体分子的な足跡となっています。しか…

　女性のX染色体のモザイク喪失に関する研究（Liu et al., 2024）が公表されました。X染色体のモザイク喪失（Mosaic loss of the X chromosome、略してmLOX）は、女性の白血球で最もよく見られる体細胞性のクローン変化ですが、その遺伝的決定要因や表現型の結果については、ほとんど分かっていません。本論…

　エディアカラ紀後期のクラウン群海綿動物を報告した研究（Wang et al., 2024）が公表されました。海綿動物は最も祖先的な後生動物門で、新原生代の海洋の酸化還元構造の調節において重要な役割を果たしたかもしれません。分子時計からは、海綿動物が新原生代に分岐した、と予測されていますが、カンブリア紀以前の海綿動物化石は明確に実証され…

　左利きと関連する遺伝的多様体についての研究（Schijven et al., 2024）が公表されました。左利きのヒトは全体の約10％で、すでにホモ・ハビリス（Homo habilis）において右利きの個体が確認されており（関連記事）、ネアンデルタール人（Homo neanderthalensis）においても右利きが圧倒的に多かっただ…

　副腎細胞の進化による雄マウスの仔育てへの影響についての研究（Niepoth et al., 2024）が公表されました。特殊化した機能を持つ細胞の種類は動物の行動を根本的に調節しますが、新たな種類の細胞の出現や、それらが行動に及ぼす影響の根底にある遺伝学的機構はよく分かっていません。本論文は、両親が仔の世話をする一夫一妻（単婚、一雄一…

　バオバブの進化史に関する研究（Wan et al., 2024）が公表されました。バオバブの木（アダンソニア属の高木類）は、その印象的な形状と、動物相との独特な関係性から、きわめて大きな注目を集めてきました。目を見張るようなこれらの木々はまた、人類の文化にも影響を及ぼし、無数の芸術や伝説、伝統に着想を与えてきており、アフリカの象徴的な…

　科の水準でのゲノム解析から鳥類の進化の複雑を示した研究（Stiller et al., 2024）が公表されました。鳥類の主要な系統間の関係については、過去数十年にわたる多大な努力にも関わらず、明確な解決策がないまま、依然として激しい議論が続いています。こうした見解の相違は、標本種の多様性、系統発生学的な方法、ゲノム領域の選択に起因す…

　取り上げるのが遅れてしまいましたが、牛乳摂取量と2型糖尿病（type 2 diabetes、略してT2D）との関連についての研究（Luo et al., 2024）が公表されました。牛乳はヒトの食性に含まれることが多いものの、牛乳摂取量と2型糖尿病との間の関係には依然として議論の余地があります。ラクターゼ（Lactase、略してLCT…

　父系微生物叢の乱れによる仔の適応度への影響に関する研究（Argaw-Denboba et al., 2024）が公表されました。腸内微生物叢は、宿主と環境が相互作用する境界面で作用し、ヒトの恒常性や代謝網に影響を及ぼします。したがって、腸内の微生物生態系の均衡を乱す環境因子は、体細胞組織全体にわたる生理学的応答および疾患関連応答を形作…

　交感神経系の起源に関する研究（Edens et al., 2024）が公表されました。神経冠は脊椎動物に固有の胚性幹細胞集団で、脊椎動物の進化は、その拡大と多様化により、新たな細胞の種類と顎や末梢神経節などの新規構造の出現が可能になったことで促進された、と考えられています。無顎脊椎動物にも感覚神経節はありますが、体幹の交感神経鎖につい…

　片親起源効果（parent-of-origin effect）を進化させた機構に関する研究（Pliota et al., 2024）が公表されました。ゲノムインプリンティングは、母親由来ゲノムと父親由来ゲノムが同等でなくなる現象で、多くの植物種および哺乳類種において独立に進化してきた重要な過程です。親族理論によれば、インプリンティング…

　ドクチョウ属（Heliconius）の同所的な雑種種分化に関する研究（Rosser et al., 2024）が報道されました。雑種形成は、複数の系統間での適応の共有を許容し、新たな種の進化を引き起こす可能性があります。しかし、同倍数体雑種種分化の説得力のある例はいまだに稀で、これは、生殖隔離を生じさせるのに雑種形成が不可欠であること…

　アラビカコーヒーノキ（Coffea arabica）の遺伝的歴史に関する研究（Scalabrin et al., 2024）が公表されました。最近の異質四倍体種であるアラビカコーヒーノキは、世界のコーヒー生産量の約60％を支えています。市販のコーヒーは、おもにロブスタコーヒーノキ（Coffea canephora）とアラビカコーヒーノ…

　取り上げるのが遅れてしまいましたが、喫煙開始年齢と脳容量の関係についての研究（Xiang et al., 2023）が公表されました。青年期におけるタバコの喫煙は差し迫った公衆衛生上の問題です。喫煙は世界的に成人の死亡原因の第1位で、全世界の喫煙に関連した死者数は2030年の時点で年間800万人に達する、と予測されています。これまでの…

　中国で発見されたジュラ紀の新種の化石哺乳類を報告した研究（Mao et al., 2024）が公表されました。シュオテリウム類は、下顎臼歯において偽タロニッドがトリゴニッドの前方にある偽トリボスフェニック型の歯を有するジュラ紀の哺乳型類（mammaliaform）で、この特徴は、タロニッドがトリゴニッドの後方にあるトリボスフェニック型…

　野生の雌のブチハイエナ（Crocuta crocuta）における社会的地位のエピジェネティックな痕跡に関する研究（Vullioud et al., 2024）が公表されました。哺乳類社会では、社会的地位が健康と繁殖実績と生存につながります。ハイエナは、地位の高い雌による地位の低い雌の支配によって強制される社会的階層を形成しており、これ…

　カカオ（Theobroma cacao）の栽培化の拡大に関する研究（Lanaud et al., 2024）が公表されました。ヒトには植物の輸送と交易の長い歴史があり（関連記事）、栽培化された植物の進化に寄与してきました。カカオは南アメリカ大陸の新熱帯区に起源があり、その現生系統は世界で最も重要な作物の一つで、その果実の中の種子（カカ…

　頂点捕食者の減少による中位捕食への遺伝的影響に関する研究（Beer et al., 2024）が公表されました。頂点捕食者の減少は世界的に広がっており、食物網の動態における変化を通じて、競争の鈍化による生態系内の下位の中域的な捕食者（中間捕食者）の活動性の強化を可能にするなど、生態系群に劇的な影響を及ぼすことがよくありますが、その進化…

　ヒョウの古代ミトコンドリアDNA（mtDNA）を報告した研究（Zhang et al., 2024）が公表されました。近年の古代DNA研究の進展は目覚ましく、やはりヒトを対象にした研究がとくに盛んですが、非ヒト動物の古代DNAデータも多数報告されるようになっています。本論文は、古代mtDNAデータからヒョウ（Panthera pard…

　キンカチョウ（Taeniopygia guttata）の求愛歌に関する研究（Alam et al., 2024）が公表されました。鳴禽類における発声の学習は、雌の選好性が雄に多種多様な囀りのレパートリーを発達させる性選択によって進化した、と考えられています。しかし、鳴禽類には、一生の間に1種類の囀りしか学ばない種も多くいます（約1/3…

　ハクジラ類（シャチ、シロイルカ、イッカクなど）の閉経の進化に関する研究（Ellis et al., 2024）が公表されました。ひじょうに稀な減少である閉経が進化した経緯や理由を明らかにすることは、さまざまな分野で長年にわたる課題となっています。雌は一般に、成体期の全体にわたり生殖を行なうことで、繁殖成功を最大化させることができます。…

　ヌタウナギのゲノムと脊椎動物の進化に関する研究（Marlétaz et al., 2024）が公表されました。ヌタウナギ類とヤツメウナギ類は、現存する唯一の無顎類系統として、脊椎動物の初期進化を探るためのきわめて重要な手がかりを提供します。本論文は、クロヌタウナギ（Eptatretus atami）の染色体規模のゲノム塩基配列を用いて…

　マルハナバチの社会的学習に関する研究（Bridges et al., 2024）が公表されました。文化とは、社会的に学習され集団内で経時的に維持される行動を指します。動物の文化にも、ヒトの文化のように累積的で、過去の新機軸に立脚する連続的な新機軸を特徴とするものがある、と示唆する証拠が増えています。しかし、ヒトの累積的な文化に関わる行…

　喫煙が免疫応答に及ぼす持続的影響に関する研究（Saint-André et al., 2024）が公表されました。重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）感染後に観察された臨床転帰の多様性からも分かるように、免疫応答（細菌感染、ウイルス感染など）は個人ごとに大きく異なり、その固有の変動性では年齢や性や遺伝的要因が大…

　ニホンオオカミ（Canis lupus hodophilax）とイエイヌ（Canis familiaris）との遺伝的近縁性を報告した研究（Gojobori et al., 2024）が公表されました。イエイヌ（イヌ）は、ハイイロオオカミ（Canis lupus）の特定集団から家畜化され、そのハイイロオオカミ集団の遺伝的構成をほぼその…

　ヒト脳の成熟が遅い理由に関する研究（Ciceri et al., 2024）が公表されました。ヒト脳の発達速度は、他のほとんどの種と比較してひじょうに遅い、と分かっています。大脳皮質ニューロンの成熟はとくに遅く、成人の機能が発達するのには数ヶ月から数年を要します。時間的調節がこのように長期にわたるのは、ヒト多能性幹細胞（human p…

　古代と現代のゲノムデータからヒグマヒグマ（Ursus arctos）の進化史を推測した研究（Segawa et al., 2024）が公表されました。2010年代以降の古代ゲノム研究の進展は目覚ましく、やはり自身の由来に直結するとともに、医療など「実用的」分野への応用も期待されることから、ヒトを対象とする古代ゲノム研究が最も盛んでしょ…

　日本列島の縄文時代と奈良時代のイヌのミトコンドリアゲノムを報告した研究（Xiaokaiti et al., 2024）が公表されました。本論文は、日本列島では最古級となるイヌ遺骸を含めて縄文時代のイヌ5個体と、8世紀後期の日本のイヌ7個体のミトコンドリアゲノムを報告しています。縄文時代のイヌは母系遺伝となるミトコンドリアゲノムでは、中…

　絶滅危惧種とされるスペインオオヤマネコ（Lynx pardinus）の遺伝的多様性は近縁種のユーラシアオオヤマネコ（Lynx lynx）との交雑により増加したことを示した研究（Lucena-Perez et al., 2024）が公表されました。この研究はオンライン版での先行公開となります。スペインオオヤマネコ（イベリアオオヤマネコ）…

　取り上げるのが遅れてしまいましたが、単一細胞水準での重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）への応答の地域集団間の差に関する研究（Aquino et al., 2023）が公表されました。SARS-CoV-2感染後のヒトの臨床症状は、個人間で大きな差異が見られ、その遺伝学的基盤や免疫学的基盤が解明され始めており、ネ…

　カエルの体色の機能に関する研究（Laumeier et al., 2024）が公表されました。小規模な研究により示されてきたのは、体色の明度差は外温動物において重要な生理学的意味を有するかもしれず、色の濃い種ほど加温速度が急で、病原体や光酸化損傷に対する保護がある、ということです。両生綱無尾目（カエルやヒキガエル）は、5000種以上か…

　景観の動態と顕生代における生物圏の多様化に関する研究（Salles et al., 2023）が公表されました。生物圏の長期的な多様化は、物理的な環境の変化に応答します。しかし、顕生代の初期において、大陸で生命の多様化が始まったのは海洋よりも遅い時期で、それはほぼ単調なものでした。これに対して、海洋の生命は時代とともに多数の属の増減を…

　絶滅したケブカサイ（Coelodonta antiquitatis）のミトコンドリアDNA（mtDNA）データを報告した研究（Yuan et al., 2023）が公表されました。ケブカサイは寒冷適応の大型草食動物で、後期更新世においてユーラシア北部全域に広範に分布しており、14000年前頃に絶滅し、人為的影響の点でも注目されます。本…

　新アッシリアの宮殿の煉瓦から得られた古代DNAを報告した研究（Arbøll et al., 2023）が報道されました。古代DNAの配列決定技術の最近の進展は、現代よりも前の文明【当ブログでは原則として文明という用語を使わないことにしていますが、この記事では「civilization」の訳語として使います】への貴重な洞察を提供してきま…

　オルドビス紀（4億9000万～4億3000万年前頃）の海洋生物多様性に対する地球規模の寒冷化の影響に関する研究（Ontiveros et al., 2023）が公表されました。地球規模の寒冷化は、顕生代の海洋性動物の最大の放散である、多様性爆発事象（Great Ordovician Biodiversification Event）と…