遺伝子移入領域を特定する新たな手法
後期ホモ属における遺伝子移入領域を特定する新たな手法について、今年（2026年）3月18日～21日にかけてアメリカ合衆国コロラド州デンバーで開催された第95回アメリカ生物学会（旧称はアメリカ自然人類学会）総会で報告されました（Rogers et al., 2026）。この報告の要約はPDFファイルで読めます（P162）。この研究は、現生人類（Homo sapiens）とネアンデルタール人（Homo neanderthalensis）と種区分未定のホモ属であるデニソワ人（Denisovan）における他系統のホモ属からの遺伝子移入領域の特定について、新たな手法を提示しています。
本研究は、遺伝子移入されたDNAを伴うゲノム領域の特定について、新たな手法を提案します。この手法は、個体の染色体上の遺伝子移入されたハプロタイプを検索せず、連鎖不平衡に依存しません。そのため、この手法は深い時間規模で既存の手法よりも検出力が高くなります。この手法は、提供人口集団からのゲノムの有無に関わらず機能します。本研究は、以前に報告されている3回の混合事象（関連記事）にこの手法を適用します。その混合事象とは、（α）ネアンデルタール人からユーラシア現代人【非アフリカ系現代人】へのDNAの寄与、（β）デニソワ人への超古代型の寄与、（σ）超古代型のネアンデルタール人およびデニソワ人の祖先への寄与です。
この3回の事象すべてについて、遺伝子移入はエクソンとPRS（promoter-like sequences、プロモーター様配列）とpELS（proximal enhancer-like sequences、近位エンハンサー様配列）で減少しており、これらの領域では選択が遺伝子移入に抵抗してきた、と示唆されます。一方で、遺伝子移入は遠位エンハンサー様配列では増加しています。先行研究では、どの領域が混合砂漠なのかについて、異なる手法は一致しない、と示されてきました。本研究の手法は、砂漠として以前に特定された領域における遺伝子移入を見つけます。
参考文献：
Rogers AR. et al.(2026): The Distribution of Superarchaic Admixture across the Genome. The 95th Annual Meeting of the AABA.
https://doi.org/10.1002/ajpa.70227
本研究は、遺伝子移入されたDNAを伴うゲノム領域の特定について、新たな手法を提案します。この手法は、個体の染色体上の遺伝子移入されたハプロタイプを検索せず、連鎖不平衡に依存しません。そのため、この手法は深い時間規模で既存の手法よりも検出力が高くなります。この手法は、提供人口集団からのゲノムの有無に関わらず機能します。本研究は、以前に報告されている3回の混合事象（関連記事）にこの手法を適用します。その混合事象とは、（α）ネアンデルタール人からユーラシア現代人【非アフリカ系現代人】へのDNAの寄与、（β）デニソワ人への超古代型の寄与、（σ）超古代型のネアンデルタール人およびデニソワ人の祖先への寄与です。
この3回の事象すべてについて、遺伝子移入はエクソンとPRS（promoter-like sequences、プロモーター様配列）とpELS（proximal enhancer-like sequences、近位エンハンサー様配列）で減少しており、これらの領域では選択が遺伝子移入に抵抗してきた、と示唆されます。一方で、遺伝子移入は遠位エンハンサー様配列では増加しています。先行研究では、どの領域が混合砂漠なのかについて、異なる手法は一致しない、と示されてきました。本研究の手法は、砂漠として以前に特定された領域における遺伝子移入を見つけます。
参考文献：
Rogers AR. et al.(2026): The Distribution of Superarchaic Admixture across the Genome. The 95th Annual Meeting of the AABA.
https://doi.org/10.1002/ajpa.70227
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